Strukturę organizacyjną Regionalnego Szpitala Specjalistycznego im. Dr Wł. Biegańskiego w Grudziądzu tworzą :
- zakłady,
- działy,
- oddziały,
- zespoły,
- poradnie,
- pracownie,
- inne szpitalne ośrodki medyczne,
- sekcje,
- inspektoraty,
- referaty,
- biura,
- gabinety

Strukturę organizacyjną Szpitala tworzą następujące działy:

I. PION DYREKTORA SZPITALA

1. DZIAŁ DIAGNOSTYCZNO – LECZNICZY tworzą:

1.1. Oddział Ratownictwa Medycznego:
1.1.1. Zespoły Ratownictwa Specjalistycznego
1.1.2. Zespoły Ratownictwa Podstawowego
1.1.3. Zespoły Transportu Sanitarnego
1.1.4. Zespół Dyspozytorów Ratownictwa Medycznego
1.1.5. SOR – Dorosłych
1.1.6. SOR – Dziecięcy
1.1.7. SOR – Położniczo - Ginekologiczny
1.1.8. Ambulatorium Pomocy Doraźnej
1.1.9. Stomatologiczna Pomoc Doraźna
1.1.10. Wyjazdowa Opieka Lekarska
1.1.11. Wyjazdowa Opieka Pielęgniarska

1.2. Oddziały szpitalne:
1.2.1. Anestezjologii i Intensywnej Terapii
1.2.2. Anestezjologii i Intensywnej Terapii dla Dzieci
1.2.3. Balneologii i Fizykoterapii
1.2.4. Chirurgii Naczyń
1.2.5. Chirurgii Ogólnej
1.2.6. Chirurgii Onkologicznej
1.2.7. Chirurgii i Traumatologii Dziecięcej
1.2.8. Chorób Wewnętrznych
1.2.9. Dializ
1.2.10. Dziecięcy
1.2.11. Dziecięco-Młodzieżowy, Endokrynologii, Kardiologii i Neurologii Dziecięcej
1.2.12. Endokrynologiczny i Terapii Izotopowej
1.2.13. Gastroenterologiczny
1.2.14. Intensywnego Nadzoru Kardiologicznego i Kardiologii Inwazyjnej
1.2.15. Kardiochirurgii
1.2.16. Kardiologii, Elektrofizjologii i Zaburzeń Rytmu
1.2.17. Medycyny Paliatywnej
1.2.18. Nefrologiczny
1.2.19. Neonatologiczny z pododdziałem Patologii i Intensywnej Terapii Noworodka
1.2.20. Neurochirurgiczny
1.2.21. Neurologiczny
1.2.22. Niemowlęcy
1.2.23. Okulistyczny
1.2.24. Onkologii Klinicznej
1.2.25. Otolaryngologiczny
1.2.26. Położniczo-Ginekologiczny
1.2.27. Psychiatrii Dzieci i Młodzieży
1.2.28. Psychiatryczny I
1.2.29. Psychiatryczny II
1.2.30. Psychiatryczny Dzienny
1.2.31. Pulmonologiczny
1.2.32. Rehabilitacji Ogólnoustrojowej
1.2.33. Rehabilitacji Neurologicznej
1.2.34. Rehabilitacji Kardiologicznej
1.2.35. Reumatologiczny
1.2.36. Terapii Długoterminowej
1.2.37. Udarowy
1.2.38. Urazowo – Ortopedyczny
1.2.39. Urologii Ogólnej i Onkologicznej
1.2.40. Zakład Pielęgnacyjno - Opiekuńczy

1.3. Poradnie specjalistyczne:
1.3.1. Ambulatorium Chemioterapii
1.3.2. Alergologiczna
1.3.3. Alergologiczna dla Dzieci
1.3.4. Anestezjologiczna
1.3.5. Audiologiczna
1.3.6. Chirurgiczna Ogólna dla Dzieci
1.3.7. Chirurgii Naczyń
1.3.8. Chirurgii Ogólnej
1.3.9. Chirurgii Onkologicznej
1.3.10. Chorób Piersi
1.3.11. Chorób Płuc i Gruźlicy
1.3.12. Chorób Zakaźnych dla Dzieci
1.3.13. Diabetologiczna dla Dzieci
1.3.14. Diagnozy i Rehabilitacji Funkcji Poznawczych
1.3.15. Dietetyczna
1.3.16. Dla Kobiet w Ciąży
1.3.17. Endokrynologiczna
1.3.18. Endokrynologiczna dla Dzieci
1.3.19. Endokrynologiczno – Ginekologiczna
1.3.20. Gastroenterologiczna
1.3.21. Ginekologiczna dla Dziewcząt
1.3.22. Ginekologiczno – Położnicza
1.3.23. Kardiochirurgiczna
1.3.24. Kardiologiczna i Zaburzeń Rytmu
1.3.25. Kardiologiczna z Pracownią Elektrokardiograficzną
1.3.26. Kardiologiczna dla Dzieci z Pracownią Echokardiograficzną
1.3.27. Kardiologii Inwazyjnej
1.3.28. Laktacyjna
1.3.29. Leczenia Bólu
1.3.30. Logopedyczna
1.3.31. Nefrologiczna
1.3.32. Nefrologiczna dla Dzieci
1.3.33. Neurologiczna
1.3.34. Neurologii Wieku Rozwojowego
1.3.35. Neurochirurgiczna
1.3.36. Okulistyczna
1.3.37. Okulistyczna dla Dzieci
1.3.38. Onkologiczna
1.3.39. Otolaryngologiczna
1.3.40. Otolaryngologiczna dla Dzieci
1.3.41. Ortopedyczna dla Dzieci
1.3.42. Patologii Ciąży i Badań Prenatalnych
1.3.43. Patologii Noworodka
1.3.44. Preluksacyjna
1.3.45. Profilaktyczna
1.3.46. Psychologiczna
1.3.47. Psychologiczna dla Dzieci i Młodzieży
1.3.48. Pulmonologiczna dla Dzieci
1.3.49. Rehabilitacyjna
1.3.50. Rehabilitacyjna dla Dzieci
1.3.51. Reumatologiczna
1.3.52. Sportowa
1.3.53. Szkoła Rodzenia
1.3.54. Udarowa
1.3.55. Urazowo-Ortopedyczna
1.3.56. Urologiczna
1.3.57. Wad Postawy
1.3.58. Zdrowia Psychicznego
1.3.59. Zdrowia Psychicznego dla Dzieci i Młodzieży
1.3.60. Hospicjum Domowe

1.4. Centrum Leczenia Cukrzycy
1.4.1. Poradnia Diabetologiczna
1.4.2. Kompleksowa Ambulatoryjna Opieka Specjalistyczna (nad chorym na cukrzycę)

1.5. Zakład Patomorfologii:
1.5.1. Pracownia Histopatologiczna
1.5.2. Pracownia Cytologiczna
1.5.3. Prosektorium Szpitalne

1.6. Zakład Radiologii Ogólnej i Diagnostyki Obrazowej:
1.6.1. Pracownia Rezonansu Magnetycznego
1.6.2. Pracownie Tomografii Komputerowej
1.6.3. Pracownie Radiologii Konwencjonalnej
1.6.4. Pracownie Ultrasonografii
1.6.5. Pracownia Mammograficzna
1.6.6. Pracownia Angiograficzna
1.6.7. Pracownia Hemodynamiczna, Elektrofizjologii i Elektroterapii Serca.

1.7. Zakład Medycyny Nuklearnej
1.7.1. Poradnia Medycyny Nuklearnej
1.7.2. Pracownia Medycyny Nuklearnej

1.8. Laboratorium Analityczne:
1.8.1. Pracownia Analityki Ogólnej
1.8.2. Pracownia Hematologii
1.8.3. Pracownia Immunochemii
1.8.4. Pracownia Biochemii
1.8.5. Pracownia Wirusologii

1.9. Laboratorium Mikrobiologiczne:
1.9.1. Pracownia Bakteriologii Ogólnej
1.9.2. Pracownia Prątka Gruźlicy
1.9.3. Pracownia Chorób Przenoszonych Drogą Płciową
1.9.4. Pracownia Mykologiczna

1.10 Inne ośrodki działalności medycznej:
1.10.1. Centralny Blok Operacyjny
1.10.2. Blok Operacyjny:
a) pediatryczny,
b) okulistyczny,
c) laryngologiczny,
d) położniczy,
e) kardiochirurgiczny z chirurgią naczyń
1.10.3. Centralna Sterylizatornia
1.10.4. Apteka Szpitalna z magazynem medycznym
1.10.5. Apteka zewnętrzna
1.10.6. Bank Krwi z Pracownią Serologiczną
1.10.7. Pracownia Badań Urodynamicznych
1.10.8. Pracownia Endoskopowa
1.10.9. Pracownia Echo dla Dzieci
1.10.10. Pracownia Prób Wysiłkowych dla Dzieci
1.10.11. Pracownia Biopsyjna
1.10.12. Zakład Fizjoterapii
1.10.13. Podstawowa Opieka Zdrowotna

2. STANOWISKA SAMODZIELNE:
2.1. Pełnomocnik Dyrektora ds. Systemu Zarządzania Jakością
2.2. Radca Prawny
2.3. Administrator Bezpieczeństwa Informacji
2.4. Inspektor OC
2.5. Kapelan szpitalny

3. ORGANY DORADCZE DYREKTORA NIETWORZĄCE ODRĘBNYCH KOMÓREK ORGANIZACYJNYCH:
3.1. Rada Ordynatorów
3.2. Rada Naukowa
3.3. Rada Oddziałowych
3.4. Komitet Terapeutyczny
3.5. Komitet Transfuzjologiczny
3.6. Komitet ds. Żywienia
3.7. Komitet ds. Jakości
3.8. Komitet ds. Zakażeń Szpitalnych
3.9. Zespół ds. Antybiotykoterapii
3.10. Zespół ds. Leczenia Bólu
3.11. Komisja ds. Zdarzeń Niepożądanych
3.12. Komisja ds. Kompletności Dokumentacji Medycznej

II. PION ZASTĘPCY DYREKTORA SZPITALA

4. DZIAŁ TECHNICZNO - EKSPLOATACYJNY tworzą:
4.1. Sekcja Techniczna
4.2. Sekcja Aparatury Medycznej
4.3. Sekcja Transportowa
4.4. Sekcja Transportu Wewnętrznego
4.5. Sekcja Gospodarcza z magazynem gospodarczym
4.6. Parking w Grudziądzu

5. DZIAŁ ZAMÓWIEŃ PUBLICZNYCH tworzą:
5.1. Referat Obsługi Zamówień
5.2. Referat Zaopatrzenia

6. DZIAŁ ENERGETYKI I OCHRONY ŚRODOWISKA tworzą:
6.1. Sekcja Elektroenergetyczna
6.2. Sekcja Ciepłowniczo – Sanitarna
6.3. Referat Gazów Medycznych
6.4. Referat Ochrony Środowiska
6.5. Referat Urządzeń Dozorowanych

7. DZIAŁ INFORMATYKI I TELETRANSMISJI tworzą:
7.1. Sekcja Informatyczna
7.2. Sekcja Teletransmisji i Telemedycyny

8. DZIAŁ INWESTYCYJNO - REMONTOWY tworzą:
8.1. Stanowisko ds. przygotowania i rozliczania procesu inwestycyjnego
8.2. Stanowisko ds. nadzoru nad sprawozdawczością i dokumentacją
8.3. Stanowisko ds. obsługi księgowo-rachunkowej
8.4. Zespół inspektorów nadzoru
8.5. Zespół remontowy

9. STANOWISKA SAMODZIELNE:
9.1. Inspektor BHP
9.2. Inspektor p/poż.

III. PION ZASTĘPCY DYREKTORA DS. PIELĘGNIARSTWA

10. INNE OŚRODKI DZIAŁALNOŚCI
10.1. DZIAŁ ŻYWIENIA tworzą:
10.1.1. Sekcja Dietetyki
10.1.2 Kuchnia
10.1.3. Stołówka
10.1.4. Magazyny żywnościowe
10.1.5. Bar
10.1.6. Kawiarnia
10.1.7 Sklep przemysłowo - spożywczy
10.2. Dział Epidemiologii
10.3. Zespół ds. Zakażeń Szpitalnych
10.4. Referat ds. Jakości
10.5. Referat ds. Szkoleń
10.6. Referat ds. Marketingu
10.7. Ekipa Sprzątająca
10.8. Sklep zaopatrzenia ortopedycznego, środków pomocniczych i sprzętu medycznego
10.9. Pawilon handlowy
10.10. Pracownik socjalny Szpitala
10.11. Dietetyk Komitetu ds. Żywienia Klinicznego

IV. PION ZASTĘPCY DYREKTORA DS. ADMINISTRACYJNO – ORGANIZACYJNYCH

11. DZIAŁ ADMINISTRACYJNO – ORGANIZACYJNY tworzą:
11.1. Referat ds. Osobowych
11.2. Referat ds. Kancelaryjno-Administracyjnych
11.3. Referat Organizacyjny
11.4. Referat ds. Promocji Zdrowia
11.5. Referat Statystyki Medycznej
11.6. Biuro Informacji i Obsługi Interesantów
11.7. Centralna Rejestracja
11.8. Składnica Akt

V. PION ZASTĘPCY DYREKTORA DS. FINANSOWYCH

12. DZIAŁ EKONOMICZNO – FINANSOWY tworzą:
12.1. Referat Księgowości Finansowej
12.2. Referat Księgowości Zarządczej
12.3. Referat Kontraktowania i Rozliczania Świadczeń Zdrowotnych
12.4. Referat Wynagrodzeń
12.5. Referat Inwentaryzacji
12.6. Kasa

9. Powyższa struktura organizacyjne funkcjonuje w formie trzech przedsiębiorstw:
? Szpital, obejmujący oddziały szpitalne,
? Ambulatoryjna Opieka Specjalistyczna, obejmująca poradnie,
? Diagnostyka, obejmująca laboratoria, diagnostykę obrazową i inne zakłady diagnostyczne.